王爱娟博士多年以来一直从事复杂网络动力学行为、多智能体系统一致性、多智能体系统下优化一致性、事件触发机制的通信方式、切换动力系统动态行为、隐私保护一致性控制、智能电网经济调度的理论研究工作。在 IEEE Transactions on Systems, Man, and Cybernetics: Systems、Neural Networks、IEEE/CAA Journal of Automatica Sinica、Journal of the Franklin Institute、Nonlinear Dynamics、Neurocomputing、IET Control Theory & Applications等国内外重要刊物发表论文17篇,发表论文被他人引用250余次。